Da li je moćniji dizajn ili evolucija?

[grigorije22]

 

Enzimi - proteini koji katalizuju hemijske reakcije - su izuzetno efikasni, zbog čega postoji veliko interesovanje da se proizvedu veštački enzimi koji bi katalizovali reakcije važne za industrijsku proizvodnju. Decenijama se pokušava sa namernom proizvodnjom enzima koji bi radili ono što mi želimo da rade, uglavnom bez uspeha. U većini slučajeva, namerni dizajn počinje od već postojećeg enzima, koji se zatim "inžinjeriše" da postigne nešto veću efikasnost, ili malkice promenjenu specifičnost.

Pre nekoliko godina, Jiang i kolege su pomoću racionalnog kompjuterskog dizajna proizveli enzim (retro-aldolazu) koji katalizuje veoma preciznu i veoma specifičnu hemijsku reakciju (hidroliza 4-hidroksi-4-(6-metoksi-2-naftil)-2-butanon u 6-metoksi-2-naftaldehid i aceton). Ova reakcija se događa sama od sebe, ali veoma sporo; enzim je ubrzava oko 15,000 puta.

Mada cifra od 15,000 izgleda impresivno, radi se o veoma malom efektu. Ovo je i dalje neuporedivo sporije i neefikasnije od prirodnih enzima. Ali je lep uspeh ideje da se može dizajnirati enzim koji na svojoj površini ima specifično mesto vezivanja potrebne hemikalije, i specifične amino-kiseline koje precizno izvode baš određenu reakciju.

U novom tekstu za Nature Chemical Biology, Giger i kolege su nastavile ovaj proces... drugačijom metodom. Umesto racionalnog dizajna pred kompjuterom, uzeli su originalni protein i počeli da u njega unose potpuno slučajne mutacije. Onda bi analizirali mutante, uzeli onaj koji radi najbolje, i na njemu izveli sledeću seriju slučajnih promena.

Rezultat? Kroz prirodnu selekciju, proizveli su enzim koji ubrzava reakciju za faktor od 25 MILIONA. Dakle, rezultat koji je hiljadama puta bolji.

Što je najzanimljivije u celoj stvari... mutacije su potpuno promenile mesto na kome se reakcija odigrava. Jiang i kolege su provele godine (i bezbrojne hiljade sati superkompjuterskog vremena) pažljivo "gradeći" aktivni "džep" originalnog enzima. Precizno su orjentisali sve delove proteina tako da dobiju što bolji rezultat.

U ovom novom eksperimentu, očekivanje je bilo da će slučajne mutacije možda malkice optimizovati i unaprediti to početno stanje. Da će dizajnirani oblik ostati isti, ali da će selekcija naći dodatna mala unapređenja koja su ljudi prevideli.

To se nije desilo. Naprotiv, niz slučajnih mutacija je taj džep potpuno uništio, proizveo potpuno novi i drugačiji džep na drugom mestu (koji mnogo preciznije vezuje početnu supstancu), i regrutovao sasvim neočekivanu amino-kiselinu da katalizuje centralni deo reakcije daleko većom brzinom.

Petim rečima, slučajne mutacije + selekcija su ne samo proizvele rezultat koji je neuporedivo bolji od namernog dizajna, već su to uradile potpuno ignorišući osnovne principe na kojima je dizajn uopšte rađen.

http://www.nature.com/nchembio/journal/v9/n8/full/nchembio.1276.html

http://www.nature.com/nchembio/journal/v9/n8/full/nchembio.1276.html

http://www.nature.com/nchembio/journal/v9/n8/full/nchembio.1276.html

www.nature.com

 

 

Miles Babbage

 

[grigorije22]

Znaci nauka ipak vodi u ateizam.

[Јанко]

Гришо, до када ћеш се замлаћивати? Има толико важнијих ствари у животу, нпр. манастир или жена и деца... А Бог ће остати Бог без обзира ко шта напише.

Вера се не доказује, већ показује по јеванђелским речима "Дођи и види".

А наука увек иде напред и не занима је где ће стићи, битно је да се трага за истином. Наука ме никад није бринула, јер следује Јеванђељу "Тражите и наћи ћете". Научници су друго питање, и често уносе своје лично, субјективно у простор неистраженог. Али, дај да не бркамо науку и научнике.

[Juan Valdez]

Miles Babbage

 

хахахахахахаххахахаха

 

0110_hahaha  0110_hahaha  0110_hahaha  0110_hahaha  0110_hahaha  0110_hahaha  0110_hahaha  0110_hahaha  0110_hahaha  0110_hahaha  0110_hahaha  0110_hahaha  

[grigorije22]

хахахахахахаххахахаха

 

0110_hahaha  0110_hahaha  0110_hahaha  0110_hahaha  0110_hahaha  0110_hahaha  0110_hahaha  0110_hahaha  0110_hahaha  0110_hahaha  0110_hahaha  0110_hahaha  

 

Da cujemo cika Ivice sta je smesno?

[Juan Valdez]

Da cujemo cika Ivice sta je smesno?

 

Смешно је што сам провалио ко се овако потписао.

[grigorije22]

Гришо, до када ћеш се замлаћивати? Има толико важнијих ствари у животу, нпр. манастир или жена и деца... А Бог ће остати Бог без обзира ко шта напише.

Вера се не доказује, већ показује по јеванђелским речима "Дођи и види".

А наука увек иде напред и не занима је где ће стићи, битно је да се трага за истином. Наука ме никад није бринула, јер следује Јеванђељу "Тражите и наћи ћете". Научници су друго питање, и често уносе своје лично, субјективно у простор неистраженог. Али, дај да не бркамо науку и научнике.

 

Mora da je neka prevara u pitanju. Slucajne mutacije rade bolje nego razum cvrc.

[grigorije22]

Смешно је што сам провалио ко се овако потписао.

 

Endonuclease

[Justin Waters]

Dakle evolutivni mehanizmi rade odlicno.

Sa druge strane imamo nesto sto se zove dizajn, ali ljudski dizjan. Taj dizajn nema nikakve veze sa bozanskim da budemo jasni.

[Juan Valdez]

Требало је да се потпише као Webad Grandma's.  4chsmu1

[Juan Valdez]

Mora da je neka prevara u pitanju. Slucajne mutacije rade bolje nego razum cvrc.

 

Јао бре, Григоријусе... Иди певај, свирај, јури женске. Опусти се. Не иде ти ово очигледно, само пуниш себи главу глупостима. Све погрешно схваташ јер с погрешним мотивима прилазиш целој ствари.

[grigorije22]

Јао бре, Григоријусе... Иди певај, свирај, јури женске. Опусти се. Не иде ти ово очигледно, само пуниш себи главу глупостима. Све погрешно схваташ јер с погрешним мотивима прилазиш целој ствари.

Kako sa pogresnim motivima kad lepo pise da slucajne mutacije bolje rade nego naucnici. To mora da je ista prica kao i sa genetskim algoritmima

koji navodno "sami os sebe" stvaraju informacije.

[Јанко]

Mora da je neka prevara u pitanju. Slucajne mutacije rade bolje nego razum cvrc.

 

Те "случајне" мутације су у ствари насумична провера нама непознатог (у смислу спознаје начина конструкције и деловања) механизма који очигледно, и поред нашег незнања, функционише.

Не контам-механизам који је Бог створио и покренуо (еволуција кроз мутације) боље шљака него људско дизајнирање-шта је ту чудно???

[Јанко]

Kako sa pogresnim motivima kad lepo pise da slucajne mutacije bolje rade nego naucnici. To mora da je ista prica kao i sa genetskim algoritmima

koji navodno "sami os sebe" stvaraju informacije.

 

Гришо, мој дипломски рад на ЕТФ-у је био "Прорачун токова снага у сложеној мрежи уз помоћ генетског алгоритма". Знаш која ми је била највећа препрека? Генерисање случајног броја (увек је псеудослучајни). Иначе је занимљива стварчица која користи принципе укрштања, мутације и селекције (истина-овде су математ. вектори, али делује слично и са ДНК  ) и даје довољно добре резултате.

[grigorije22]

случајне"

 

Ovo je problem slucajne slucajnost iskljucuje razum a samim tim i Boga. Ali mora da postoji razlika izmedju ovoga sto je radjeno u labaratoriji i onoga

sto bi se desavalo u prirodi bez ljudskog nadzora. Mozda postoje neki prirodni mehanizmi koji su kreirani da ovo rade a ne slucajnost.